Comment synthétiser une protéine chimiquement?

Le moyen facile:

Insérez un gène codant pour la protéine désirée dans le génome de E. Coli et demandez-leur de faire le travail pour vous. Mais puisque je ne suis pas biologiste, je vous présente …

La manière (incroyablement) difficile:

Les acides aminés qui composent les protéines peuvent être liés ensemble par une réaction d’amidification, qui formerait des liaisons peptidiques. Maintenant, si nous jetons simplement la glycine et la proline ensemble, nous avons quatre produits possibles:

  1. Glycine-glycine
  2. Glycine-proline
  3. Proline-glycine
  4. Proline-proline

Le moyen de contourner ce problème est d’installer un groupe protecteur à une extrémité de chacun des acides aminés que nous réagissons. Cela rend les groupes protégés non réactifs, de sorte que seuls les COOH (acide carboxylique) et NH2 (amine) non protégés peuvent réagir.

Disons que nous voulions faire un tripeptide, Val-Gly-Asp. Nous protégerons d’abord le COOH de la valine et le NH2 de la glycine, puis procéderons à la réaction d’amidification. Ensuite, nous retirerions le groupe protecteur de la glycine et protégerions les deux groupes COOH de l’aspartate (rappelons que sa chaîne latérale se termine par un acide carboxylique). L’extrémité C du dipeptide de Val-Gly est toujours protégée de l’étape précédente, vous n’avez donc pas à vous en soucier ici. Exécutez à nouveau l’amidification et supprimez les groupes protecteurs restants.

Vous pouvez imaginer que ce serait un processus très difficile, en particulier pour une protéine qui a une longueur de centaines d’acides aminés. Cela ne tient même pas compte du fait que vous perdriez du produit à chaque étape (le dernier article que j’ai vu décrivant une réaction d’amidification rapportait des rendements de 40% à 95%, maintenant imaginez-vous la faire fonctionner cent fois). En outre, je peux imaginer des problèmes si l’amidification impliquait l’addition à un acide aminé non polaire, car il s’enterrerait dans la protéine et deviendrait quelque peu inaccessible aux groupes entrants, en particulier polaires.

En résumé, je voudrais rester avec la manière facile. Même si je ne suis pas biologiste.